Mô hình không gian
Một tác phẩm kinh điển trong lĩnh vực này là bài báo của Alan Turing về hình thái học có tiêu đề Cơ sở Hóa học của Morphogenesis, xuất bản năm 1952 trong Các Giao dịch triết học của Hiệp hội Hoàng gia.

- Sóng du lịch trong một bài kiểm tra vết thương vết thương
- Hành vi Swarming
- Một lý thuyết mechanochemical của morphogenesis
- Sự hình thành sinh học
- Mô hình phân bố không gian sử dụng các mẫu âm mưu
Sinh học tổ chức
Các phương pháp tiếp cận lý thuyết đối với tổ chức sinh học nhằm mục đích hiểu được sự phụ thuộc lẫn nhau giữa các bộ phận của sinh vật. Họ nhấn mạnh các thông tư mà các sự phụ thuộc lẫn nhau này dẫn đến. Các nhà sinh học lý thuyết đã phát triển một số khái niệm để chính thức hoá ý tưởng này.
Ví dụ, sinh học quan hệ học trừu tượng (ARB) liên quan đến việc nghiên cứu các mô hình chung, mô hình quan hệ của các hệ thống sinh học phức tạp, thường là trừu tượng các cấu trúc hình thái, hoặc cấu trúc giải phẫu cụ thể. Một số mô hình đơn giản nhất trong ARB là Metabolic-Replication, hoặc (M, R) – các hệ thống được giới thiệu bởi Robert Rosen trong những năm 1957-1958 như những mô hình trừu tượng, quan hệ của tổ chức tế bào và tổ chức.
Các phương pháp tiếp cận khác bao gồm khái niệm về tự động phát triển bởi Maturana và Varela, chu trình công việc của Constraints của Kauffman, và gần đây là khái niệm đóng những ràng buộc.
Đại số học sinh học
Sinh học đại số (còn được gọi là sinh học hệ thống biểu tượng) áp dụng các phương pháp đại số tính toán biểu tượng để nghiên cứu các vấn đề sinh học, đặc biệt là trong genomics, proteomics, phân tích các cấu trúc phân tử và nghiên cứu các gen.