Nhiều hộp mực “thông minh” chứa một microchip truyền đạt mực mực ước tính cho máy in; Điều này có thể gây ra máy in hiển thị thông báo lỗi hoặc thông báo không chính xác cho người dùng rằng hộp mực trống. Trong một số trường hợp, các tin nhắn này có thể bị bỏ qua, nhưng một số máy in phun sẽ từ chối in bằng hộp mực tuyên bố rằng sản phẩm đó trống rỗng, để ngăn người tiêu dùng tái nạp hộp mực. Ví dụ, Epson đã nhúng một chip để ngăn chặn việc in ấn khi chip tuyên bố hộp mực rỗng, mặc dù một nhà nghiên cứu đã vượt qua hệ thống thấy rằng trong một trường hợp, ông có thể in đến 38% trang chất lượng tốt hơn, Rằng hộp mực trống rỗng [12]. Các nhà cung cấp mực in của bên thứ ba bán mực in với mức giảm đáng kể (ít nhất 10-30% giá mực hộp mực OEM, đôi khi lên đến 95%, trung bình khoảng 50%), cũng như mực in và hộp mực tự nạp lại với giá thấp hơn . Nhiều hộp mực in “thông minh” của các nhà cung cấp đã được thiết kế ngược lại. Bây giờ có thể mua các thiết bị rẻ tiền để thiết lập lại các hộp mực như vậy để báo cáo là đầy đủ, để chúng có thể được nạp lại nhiều lần.
Độ bền lâu dài của các bản in phun đầu khá thấp, mặc dù các công thức mực in cải tiến đã cải thiện đáng kể thuộc tính này. Xem phần về độ bền để biết thêm thông tin.
Các vòi phun in phun rất hẹp có khuynh hướng tắc nghẽn. Mực in được sử dụng để làm sạch chúng – hoặc trong suốt quá trình dọn dẹp bởi người sử dụng, hoặc trong nhiều trường hợp, được thực hiện tự động bởi máy in theo một quy trình thông thường – có thể chiếm một tỷ lệ đáng kể mực in được sử dụng trong máy. Đầu phun đầu in phun có thể được làm sạch bằng dung môi chuyên dụng; Hoặc bằng cách ngâm trong nước cất nóng trong một khoảng thời gian ngắn, đối với các loại mực hòa tan trong nước.

Mực và hộp mực của bên thứ ba
Chi phí cao của hộp mực OEM và những trở ngại cố ý để nạp lại chúng đã được giải quyết bởi sự phát triển của các nhà cung cấp mực của bên thứ ba. Nhiều nhà sản xuất máy in không khuyến khích khách hàng sử dụng mực in của bên thứ ba, chỉ ra rằng chúng có thể làm hỏng đầu in do không có cùng công thức như mực OEM, gây rò rỉ và tạo ra đầu ra chất lượng kém hơn (ví dụ: khoảng màu không chính xác). Báo cáo của Người tiêu dùng đã lưu ý rằng một số hộp mực của bên thứ ba có thể chứa ít mực hơn hộp mực OEM, và do đó không tiết kiệm chi phí, trong khi Wilhelm Imaging Research tuyên bố rằng với mực của bên thứ ba, tuổi thọ của các bản in có thể được giảm đáng kể. ] Tuy nhiên, một cuộc tổng kết tháng 4 năm 2007 cho thấy, trong một cuộc kiểm tra mù đôi, người đánh giá thường thích sản phẩm được sản xuất bằng mực in của bên thứ ba thông qua mực OEM. Nhìn chung, các loại mực OEM đã trải qua thử nghiệm đáng tin cậy về hệ thống với mực và vật liệu in, trong khi các nỗ lực nghiên cứu và phát triển về khả năng tương thích của mực in bên thứ ba sẽ ít hơn đáng kể. Một số nhà sản xuất máy in phun đã cố gắng ngăn ngừa các hộp mực được nạp lại bằng cách sử dụng các chương trình khác nhau bao gồm lắp chip vào các hộp mực ghi lại lượng mực in đã in và ngăn hoạt động của hộp mực đã nạp lại.
Bảo hành trên máy in có thể không áp dụng nếu máy in bị hư hỏng do sử dụng các vật liệu không được chấp thuận. Ở Mỹ, Đạo luật Bảo hành Magnuson-Moss là luật liên bang quy định rằng người bảo lãnh không thể yêu cầu chỉ sử dụng các bộ phận và hàng hoá thương hiệu với sản phẩm của họ, như một số nhà sản xuất máy in gợi ý. Tuy nhiên, điều này sẽ không áp dụng nếu các mục không được chấp nhận gây ra thiệt hại. Ở Anh, một nhà sản xuất máy in không thể áp đặt hợp pháp các điều kiện như là một phần của bảo hành (Regina Vs Ford Motor Company đề cập) mặc dù nhiều người cố gắng làm như vậy bất hợp pháp. Miễn là sản phẩm được sử dụng đã được bán như máy in mà nó được sử dụng, thì hành động bán hàng sẽ được áp dụng, và mọi thứ được bán như vậy phải “có chất lượng hàng hoá và phù hợp với mục đích”. Hơn nữa, theo luật của Anh, nó là nhà bán lẻ chứ không phải là nhà sản xuất chịu trách nhiệm pháp lý, trong 2 năm đối với các mặt hàng vận hành bằng điện và như vậy thì nhà bán lẻ là nơi mà người ta sẽ tìm cách khắc phục