Bối cảnh
Khái niệm nằm dưới cơ chế khảo sát SCGE là DNA không bị hư hỏng giữ lại mối liên kết có tổ chức cao với các protein ma trận trong hạt nhân. Khi bị hư hỏng, tổ chức này bị gián đoạn. Các sợi DNA riêng lẻ mất cấu trúc nhỏ gọn của chúng và thư giãn, phát triển ra khỏi khoang trong agarose. Khi điện trường được ứng dụng DNA, có tổng lượng điện âm âm, được rút ra theo cực dương tích điện. Các chuỗi DNA không bị hư hỏng quá lớn và không để lại khoang chứa, trong khi các mảnh nhỏ hơn, chúng càng được tự do di chuyển trong một khoảng thời gian nhất định. Do đó, số lượng DNA rời khỏi khoang là một thước đo mức độ tổn thương DNA trong tế bào.
Các phân tích hình ảnh đo cường độ tổng thể của huỳnh quang cho toàn bộ hạt nhân và huỳnh quang của DNA di chuyển và so sánh hai tín hiệu. Càng mạnh tín hiệu từ ADN di chuyển càng có nhiều thiệt hại. Cấu trúc tổng thể giống như sao chổi (vì thế có nghĩa là “sao chổi sao chổi”) với một đầu tròn tròn tương ứng với DNA không bị hư hỏng vẫn còn trong khoang và đuôi của DNA bị hư hỏng. Cái đuôi sáng và dài hơn, mức độ thiệt hại càng cao.
Cuộc khảo sát sao chổi là một kỹ thuật linh hoạt để phát hiện thiệt hại và với sự điều chỉnh của giao thức có thể được sử dụng để định lượng sự hiện diện của nhiều thay đổi DNA tổn thương (thiệt hại). Các thiệt hại thường được phát hiện là phá vỡ sợi đơn và phá vỡ sợi đôi. Đôi khi người ta nói Rằng các điều kiện kiềm và denaturating hoàn chỉnh của DNA là cần thiết để phát hiện sự phá vỡ sợi đơn. Tuy nhiên, điều này là không đúng, cả hai đơn và đôi sợi phá vỡ cũng được phát hiện trong điều kiện trung lập . Tuy nhiên, trong các điều kiện kiềm, các cấu trúc DNA bổ sung được phát hiện là hư hại DNA: các vị trí AP (các vị trí abasic mất tích hoặc là một pyrimidin hoặc purine nucleotide) và các địa điểm nơi sửa chữa cắt bỏ được thực hiện.
Cuộc khảo sát sao chổi là một cuộc khảo sát tổn thương DNA rất nhạy cảm. Độ nhạy này cần phải được xử lý cẩn thận vì nó cũng dễ bị tổn thương trước những thay đổi thể chất có thể ảnh hưởng đến khả năng lặp lại của kết quả. Về cơ bản, bất cứ điều gì có thể gây ra thiệt hại DNA hoặc denaturation trừ các yếu tố nghiên cứu sẽ được tránh. Hình thức phổ biến nhất của bài kiểm tra là phiên bản kiềm mặc dù vẫn chưa có một quy trình kiểm tra kiềm xác định. Do thiết lập đơn giản và không tốn kém, nên nó có thể được sử dụng trong điều kiện không có xét nghiệm phức tạp hơn.
Các ứng dụng
Chúng bao gồm xét nghiệm gen độc tính, giám sát sinh học của con người và dịch tễ học phân tử, sinh thái sinh học, cũng như các nghiên cứu cơ bản về phá hủy và sửa chữa DNA.
Xét nghiệm máu cho bệnh ung thư
Vào năm 2014, một nhóm nghiên cứu Anh đã sử dụng phương pháp khảo sát sao chổi trong một thử nghiệm xác định được các tế bào bạch cầu của bệnh nhân ung thư, khác với những người không có ung thư. Hy vọng của họ là đây có thể là một xét nghiệm máu đơn giản có thể phát hiện ra tất cả các bệnh ung thư.
Các nhà khoa học từ Đại học Bradford cho đến nay đã sử dụng kỹ thuật của họ trên ba loại ung thư với kết quả hứa hẹn.
Hy vọng rằng trong thời gian thử nghiệm có thể ngăn ngừa các thủ tục tốn kém và xâm lấn như colonoscopies và sinh thiết.
Giáo sư Diana Anderson thuộc Khoa Khoa học Đời sống Đại học Bradford, người đứng đầu cuộc nghiên cứu, cho biết: “Các tế bào bạch cầu là một phần của hệ thống phòng vệ tự nhiên của cơ thể Chúng ta biết rằng chúng đang bị căng thẳng khi đang chiến đấu với bệnh ung thư hoặc các bệnh khác, Tôi tự hỏi liệu có thể nhìn thấy bất cứ điều gì có thể đo lường được nếu chúng ta đặt chúng dưới áp lực tiếp theo với tia UVA.Chúng tôi phát hiện ra rằng những người bị ung thư có DNA dễ bị tổn thương bởi ánh sáng cực tím so với những người khác, do đó xét nghiệm cho thấy độ nhạy cảm đối với tổn thương của tất cả DNA – bộ gen – trong tế bào, đây là những kết quả sớm được hoàn thành trên ba loại ung thư khác nhau và chúng tôi chấp nhận rằng cần phải nghiên cứu thêm nữa, nhưng những kết quả này rất đáng chú ý “.
Quan điểm này được hỗ trợ bởi Cancer Research UK, nhấn mạnh nghiên cứu này đang ở giai đoạn rất sớm.
Sự phân mảnh DNA tinh trùng
Một cuộc khảo sát Sao chổi có thể xác định mức độ phân mảnh DNA trong tinh trùng. Mức độ phân mảnh DNA đã được kết hợp với kết quả thụ tinh trong ống nghiệm
Sao chổi đã được sửa đổi để sử dụng với các tế bào tinh trùng như một công cụ chẩn đoán vô sinh nam
Để phá vỡ các protein protamine bị ràng buộc chặt chẽ này để sử dụng Tinh tinh sao cho tinh trùng, các bước bổ sung trong quy trình ngưng tụ là cần thiết