Chromatography cột là giai đoạn cực kì tốn thời gian trong bất kỳ phòng thí nghiệm nào và có thể nhanh chóng trở thành nút cổ chai cho bất kỳ phòng thí nghiệm quy trình. Do đó, một số nhà sản xuất như Biotage, Buchi, Interchim và Teledyne Isco đã phát triển các hệ thống sắc ký tự động flash (thường được gọi là LPLC), giúp giảm thiểu sự tham gia của con người vào quá trình thanh lọc . (HPLC) như bơm gradient, cổng tiêm mẫu, máy dò tia cực tím và một bộ phận thu để thu thập chất rửa giải. Thông thường các hệ thống tự động này có thể tách mẫu từ vài miligam thành quy mô công nghiệp nhiều kilôgam và đưa ra giải pháp rẻ hơn và nhanh hơn để thực hiện nhiều lần tiêm trên các hệ thống prep-HPLC.
Độ phân giải (hoặc khả năng tách một hỗn hợp) trong một hệ thống LPLC sẽ luôn thấp so với HPLC, vì vật liệu đóng gói trong cột HPLC có thể nhỏ hơn nhiều, điển hình chỉ có 5 micrometre do đó gia tăng diện tích pha tĩnh, tăng tương tác bề mặt Và chia tay tốt hơn. Tuy nhiên, việc sử dụng phương tiện đóng gói nhỏ này gây áp lực trở lại cao và là lý do tại sao nó được gọi là sắc ký lỏng cao áp. Các cột LPLC thường được đóng gói với silica khoảng 50 micrometres, do đó làm giảm áp suất và độ phân giải trở lại, nhưng nó cũng loại bỏ được nhu cầu về máy bơm áp suất cao đắt tiền. (MPLC) hoạt động trên 1 MPa (150 psi), được sử dụng rộng rãi nhất trong lĩnh vực hệ thống sắc ký lỏng.