Đầy đủ MS
Khi thu thập dữ liệu ở chế độ quét toàn bộ, phạm vi đích của các mẩu khối được xác định và đưa vào phương pháp của dụng cụ. Một ví dụ của một phạm vi rộng lớn điển hình của các mảng khối lượng để giám sát sẽ là m / z 50 đến m / z 400. Việc xác định phạm vi sử dụng nào chủ yếu là do cái mà người ta dự đoán trong mẫu khi biết rõ về dung môi và các Có khả năng nhiễu loạn. MS không nên được đặt để tìm các mảnh quá thấp hoặc người nào khác có thể phát hiện không khí (được tìm thấy như m / z 28 do nitrogen), carbon dioxide (m / z 44) hoặc các sự can thiệp có thể khác. Ngay cả khi người ta sử dụng một phạm vi quét lớn thì độ nhạy của thiết bị sẽ giảm do thực hiện quét ít hơn mỗi lần vì mỗi lần quét sẽ phải phát hiện ra một loạt các mảnh vỡ.
Toàn quét là hữu ích trong việc xác định các hợp chất không rõ trong một mẫu. Nó cung cấp nhiều thông tin hơn SIM khi nói đến việc xác nhận hoặc giải quyết các hợp chất trong một mẫu. Trong quá trình phát triển phương pháp công cụ, có thể phổ biến để phân tích các giải pháp thử nghiệm đầu tiên ở chế độ quét toàn bộ để xác định thời gian lưu giữ và dấu vân tay của một khối lượng lớn trước khi chuyển sang phương pháp của thiết bị SIM.
Theo dõi ion chọn lọc
Trong giám sát ion chọn lọc (SIM) một số đoạn ion nhất định được nhập vào phương pháp đo và chỉ có những mảnh vỡ đó được phát hiện bởi phổ kế khối. Những lợi thế của SIM là giới hạn phát hiện thấp hơn vì dụng cụ chỉ nhìn vào một số lượng nhỏ các đoạn (ví dụ ba đoạn) trong mỗi lần quét. Nhiều lần quét có thể diễn ra mỗi giây. Vì chỉ có một vài đoạn quan tâm đang được theo dõi, các nhiễu ma trận thường thấp hơn. Để xác nhận thêm khả năng có kết quả dương tính, điều quan trọng là đảm bảo rằng tỷ số ion của các mẩu khối khác nhau có thể so sánh với một tham chiếu tiêu chuẩn đã biết.