Sự ra đời của vi khuẩn học
Các nhà nghiên cứu về vi khuẩn và các vi khuẩn quang hợp đã được Ferdinand Cohn, một nhà thực vật học nghiên cứu về một số vi khuẩn kể cả Bacillus và Beggiatoa thành lập vào thế kỷ 19 bởi lĩnh vực nghiên cứu vi khuẩn (sau này là một phương pháp phân loại vi sinh học). Cohn cũng là người đầu tiên xây dựng một kế hoạch phân loại các loại vi khuẩn và phát hiện bào tử . Louis Pasteur và Robert Koch là những người cùng thời với Cohn và thường được coi là cha của vi sinh học và vi sinh vật học y học tương ứng. Pasteur nổi tiếng với hàng loạt các thí nghiệm được thiết kế để bác bỏ lý thuyết đã được phổ biến rộng rãi của thế hệ tự phát, do đó củng cố tính đồng nhất của vi sinh học như một khoa học sinh học. Một trong những sinh viên của ông, Adrien Certes, được coi là người sáng lập ra vi sinh vật biển. Pasteur cũng đã thiết kế các phương pháp bảo quản thực phẩm (thuốc tiệt trùng) và vắc-xin chống lại một số bệnh như bệnh than, bệnh tả và bệnh dại. Koch nổi tiếng với những đóng góp của mình vào lý thuyết bệnh lý mầm bệnh, chứng minh rằng các bệnh cụ thể là do các vi sinh vật gây bệnh cụ thể. Ông đã phát triển một loạt các tiêu chí đã được biết đến như là các định đề của Koch. Koch là một trong những nhà khoa học đầu tiên tập trung vào việc cô lập các vi khuẩn trong môi trường thuần túy, dẫn đến mô tả của ông về một số vi khuẩn mới trong đó có Mycobacterium tuberculosis, tác nhân gây bệnh lao
Trong khi Pasteur và Koch thường được coi là những người sáng lập vi sinh học, công việc của họ đã không phản ánh chính xác sự đa dạng thực sự của thế giới vi sinh vật do tập trung độc quyền vào vi sinh vật có liên quan trực tiếp tới y học. Mãi cho đến cuối thế kỷ 19 và công trình của Martinus Beijerinck và Sergei Winogradsky rằng sự mở rộng thực sự của vi sinh vật đã được tiết lộ. Beijerinck đã có hai đóng góp lớn cho vi sinh học: phát hiện virus và phát triển các kỹ thuật nuôi cấy làm giàu. Trong khi nghiên cứu của ông về virus Mosaic Tobacco đã đưa ra các nguyên tắc cơ bản về virus học, đó là sự phát triển của ông về nuôi cấy làm giàu có ảnh hưởng trực tiếp nhất đến vi sinh học bằng cách cho phép trồng nhiều loại vi khuẩn khác nhau với các sinh lý học khác nhau. Winogradsky là người đầu tiên phát triển khái niệm hóa thạch học và do đó tiết lộ vai trò thiết yếu của các vi sinh vật trong quá trình hóa học địa chất. Ông chịu trách nhiệm về sự cô lập và mô tả đầu tiên của cả vi khuẩn nitrat hóa và nitơ-fixing . Nhà vi sinh vật học người Pháp-Canada Felix d’Herelle đồng khám phá ra các vi khuẩn và là một trong những nhà vi sinh vật học ứng dụng sớm nhất .
Joseph Lister là người đầu tiên sử dụng chất khử trùng phenol trên vết thương hở của bệnh nhân.
Chi nhánh
Phòng thí nghiệm vi sinh thực phẩm tại Khoa Công nghệ Thực phẩm, Đại học Nông nghiệp Latvia.
Bài chi tiết: Chi nhánh của vi sinh học
Các ngành vi sinh học có thể được phân thành khoa học thuần túy và khoa học ứng dụng. Vi sinh vật học cũng có thể được phân loại dựa trên phân loại, trong các trường hợp vi khuẩn học, bệnh học, protozoology, và khoa học thực vật. Có sự chồng chéo đáng kể giữa các ngành vi sinh học cụ thể với nhau và với các ngành khác, và các khía cạnh nhất định của các chi nhánh này có thể vượt quá phạm vi của vi sinh học truyền thống